摘要：一项研究使用了先进的遗传和基因组技术，为理解和诊断传染性肠道疾病提供了重要的一步。这项大规模研究分析了来自腹泻病人的1,000多个粪便样本，以利用两种尖端工具。该研究使用了元基因组学（基于DNA）和元文字（基因或基于RNA的）测序。与传统方法不同，这些技术不依赖于实验室中生长的生物。相反，他们直接从患者样本中检测和分析遗传物质。...

利物浦大学的一项研究使用了先进的遗传和基因组技术，为理解和诊断传染性肠道疾病提供了重要一步。

这项大规模研究分析了来自腹泻病人的1,000多个粪便样本，以利用两种尖端工具。

腹泻是传染性肠道疾病的常见症状，在英国每年影响约1800万人。然而，尽管有盛行的率，但传统的实验室测试通常无法识别出其原因，尤其是当感染是由于无法识别或新兴病原体引起的。这项新发表的研究使用了元基因组学（基于DNA）和元文字（基因或基于RNA的）测序。与传统方法不同，这些技术不依赖于实验室中生长的生物。相反，他们直接从患者样本中检测和分析遗传物质。

利物浦大学感染，兽医和生态科学研究所，兽医与生态科学研究所Edward Cunningham-Oakes博士说：“这是英国最大的研究，将传统诊断与这些下一代工具进行比较。我们不仅通过标准测试错过了创建的感染，而且我们可以看到在gut中做什么，这是什么在做什么 - 不能显示出标准诊断。

这项工作首次捕获了直接从人粪样品中的沙门氏菌基因表达的全面快照。转录组数据为细菌离开人肠道后如何生存和适应提供了新的见解。由于沙门氏菌仍然是英国优先腹泻病原体，因此知识对于帮助科学家瞄准这种危险的病原体是无价的。

该研究的主要发现突出了RNA测试在检测隐藏感染（包括难以捉摸的寄生虫和RNA病毒）方面的功能，同时还鉴定了哪些基因在感染过程中具有活性。值得注意的是，即使没有防腐剂，RNA在粪便样品中仍然保持稳定，这表明它比以前想象的要强大。值得注意的是，RNA与DNA的比率有助于区分真实的感染与无害的肠道微生物。通过结合DNA和RNA数据，研究人员获得了感染过程中最清晰，最准确的图片。

该大学基因组研究中心联合主任Alistair Darby联合主教教授说：“这项研究表明了遗传工具如何彻底改变我们如何识别和理解肠道感染。不仅了解那里的事情，而且还可以改善公共卫生的反应，尤其是在粮食生存的爆发周围，我们可以改善公共卫生的反应。”

这些发现可能会严重影响在英国及其他地区诊断，管理和研究的腹泻疾病的方式，尤其是鉴于对不依赖过时培养方法的快速，准确诊断的需求的增长。

这项研究还强调了利物浦基因组研究中心（CGR）和新的微生物组和传染病（MAID）倡议的战略作用，该倡议是利物浦城地区生命科学创新区的一部分。

Alistair Darby教授继续说：“这不仅仅是诊断感染 - 这是关于在医疗保健中建立创新平台。我们先前的工作表明，医疗保健专业人员对此持开放态度。通过使数据开放，我们希望帮助其他研究人员，NHS实验室和公共卫生机构在我们的工作中建立。”

爱德华·坎宁安 - 奥克斯（Edward Cunningham-Oakes）博士补充说：“我们的结果表明，RNA曾经认为过于脆弱，无法在粪便测试中使用，实际上可以使我们对感染的工作原理有很强的见解。这为更有效地诊断和治疗这些疾病打开了新的可能性。”

这项由利物浦大学的科学家领导的研究，包括沙门氏菌专家Blanca Perez-Sepulveda博士和Jay Hinton教授。