摘要:蛋白质是生物学研究最多的分子之一,但是新的研究表明,它们仍然可以藏有令人惊讶的秘密。研究人员在存档蛋白质结构中发现了先前未发现的化学键,揭示了蛋白质化学的意外复杂性。这些新鉴定的氮氧硫硫硫(NOS)链接扩大了我们对蛋白质如何应对氧化应激的理解,在这种情况下,有害氧基的分子堆积并可能损害细胞的蛋白质,DNA和其他必要部分。...
蛋白质是生物学研究最多的分子之一,但是哥廷根大学的新研究表明,它们仍然可以拥有令人惊讶的秘密。研究人员在存档蛋白质结构中发现了先前未发现的化学键,揭示了蛋白质化学的意外复杂性。这些新鉴定的氮氧硫硫硫(NOS)链接扩大了我们对蛋白质如何应对氧化应激的理解,在这种情况下,有害氧基的分子堆积并可能损害细胞的蛋白质,DNA和其他必要部分。新发现发表在通信化学。
研究团队系统地重新分析了来自蛋白质数据库的86,000多个高分辨率蛋白质结构,蛋白质数据库是一个全球蛋白质结构的公共存储库,他们使用了一种新算法,他们在房屋中开发了一种称为SimplifiedBondfinder的算法。该管道结合了机器学习,量子机械建模和结构改进方法,以揭示传统分析所遗漏的微妙化学键。出乎意料的是,NOS连接不限于先前已知的氨基酸对,而是在精氨酸 - 半胱氨酸和甘氨酸 - 半胱氨酸之间发现的。 NOS联系是由GöttingenUniversity的Kai Tittmann教授领导的研究首先发现的。
领导这项研究的哥廷根大学物理化学研究所的索菲亚·巴齐(Sophia Bazzi)博士说:“我们的工作表明蛋白质数据库仍然具有隐藏的化学作用。” “通过开发新的数字工具并重新审视现有数据,我们发现了数十年来一直没有注意到的化学相互作用。”这些NOS键充当分子开关,在氧化应激下稳定蛋白质,并可能影响整个生物过程。巴齐补充说:“我们的方法具有更大的影响。” “它可能会发现被忽视的化学键,从而改善蛋白质模型,并推进蛋白质工程,药物设计和合成生物学。”